46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1667 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  100 
 
 
642 aa  1264    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  39.71 
 
 
569 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  33.99 
 
 
609 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  32.66 
 
 
637 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  32.28 
 
 
533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  27.54 
 
 
428 aa  115  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  28.01 
 
 
431 aa  97.8  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  27.9 
 
 
431 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  25.53 
 
 
432 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  24.54 
 
 
437 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  27.12 
 
 
450 aa  92  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  26.32 
 
 
437 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  26.74 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  22.73 
 
 
436 aa  87  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  26.3 
 
 
430 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  22.83 
 
 
449 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  24.57 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  27.74 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  24.63 
 
 
521 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  28.4 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  22.26 
 
 
352 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  22.5 
 
 
354 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  20.04 
 
 
815 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  23.17 
 
 
521 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  22.65 
 
 
563 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  24.64 
 
 
378 aa  57.4  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0771  hypothetical protein  19.51 
 
 
875 aa  55.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  20.63 
 
 
875 aa  53.9  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  20.78 
 
 
969 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  20.59 
 
 
824 aa  53.9  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  24.35 
 
 
459 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  22.65 
 
 
373 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  25.59 
 
 
380 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0984  hypothetical protein  22.55 
 
 
408 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  20.29 
 
 
520 aa  48.9  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4247  hypothetical protein  28.21 
 
 
379 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  21.54 
 
 
547 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  23.43 
 
 
369 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0070  hypothetical protein  28.9 
 
 
408 aa  47.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0968  hypothetical protein  24.57 
 
 
410 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  19.93 
 
 
520 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  23.71 
 
 
415 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1005  hypothetical protein  25.82 
 
 
788 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  24.57 
 
 
411 aa  44.3  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.56 
 
 
5010 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2055  conserved hypothetical protein  19.92 
 
 
835 aa  43.9  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0590406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>