83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1415 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 372 aa  757    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  70.67 
 
 		 389 aa  546  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  66.84 
 
 		 393 aa  534  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  74.5 
 
 		 368 aa  531  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  65.63 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  45.11 
 
 		 565 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  48.54 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  44.73 
 
 		 800 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.77 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  42.9 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  44.41 
 
 		 321 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  44.09 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  44.38 
 
 		 792 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  38.21 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.24 
 
 		 863 aa  239  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.89 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.88 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  42.86 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  42.26 
 
 		 856 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  37.27 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  37.27 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 		 826 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  38.51 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.6 
 
 		 872 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  36.97 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  38.53 
 
 		 820 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  42.51 
 
 		 841 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  42.2 
 
 		 811 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  42.17 
 
 		 859 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  42.17 
 
 		 859 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  41.87 
 
 		 859 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  36.39 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.6 
 
 		 859 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  42.73 
 
 		 852 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  45.02 
 
 		 838 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  42.3 
 
 		 859 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.99 
 
 		 875 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  40.71 
 
 		 842 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  42.86 
 
 		 836 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  41.72 
 
 		 867 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  41.93 
 
 		 860 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.64 
 
 		 859 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  41.3 
 
 		 857 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 881 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  41.21 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  39.34 
 
 		 779 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  40.96 
 
 		 871 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  43.43 
 
 		 884 aa  209  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  42.04 
 
 		 430 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  44.72 
 
 		 899 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  43.47 
 
 		 944 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  39.08 
 
 		 841 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 		 757 aa  199  9e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.13 
 
 		 741 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.68 
 
 		 737 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.07 
 
 		 737 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  32.9 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  35.78 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  35.78 
 
 		 318 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  38.93 
 
 		 336 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  35.9 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  37.04 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  35.69 
 
 		 307 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  35.69 
 
 		 325 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  22.59 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  25.4 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  21.9 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  24.14 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  21.4 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  25 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  21.95 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  27.04 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  22.61 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  25.11 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  25.11 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  25.11 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  23.01 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>