More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1388 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  100 
 
 
145 aa  286  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  54.93 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  43.88 
 
 
147 aa  120  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  45 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  44.52 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  42.07 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  47.14 
 
 
144 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  44.37 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  46.15 
 
 
158 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  42.66 
 
 
290 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  41.73 
 
 
207 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  43.06 
 
 
149 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  39.01 
 
 
145 aa  100  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  42.55 
 
 
208 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  38.62 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  43.24 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  41.33 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  44.76 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.44 
 
 
288 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.4 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.71 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  41.73 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
145 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  40.61 
 
 
169 aa  94  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  39.01 
 
 
300 aa  94  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.26 
 
 
141 aa  94  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
145 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  45.59 
 
 
281 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  42 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  38.19 
 
 
150 aa  89.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.86 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
145 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  41.43 
 
 
280 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  42.55 
 
 
307 aa  87.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.03 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  39.04 
 
 
301 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.92 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  36.11 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.88 
 
 
286 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  39.44 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.65 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  36.11 
 
 
301 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  39.29 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  37.5 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  38.57 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.88 
 
 
287 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.14 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.86 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  40.85 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  32.86 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.46 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.88 
 
 
294 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.64 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.21 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  40.43 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.41 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.99 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.88 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.13 
 
 
283 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  36.62 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  35.92 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  34.31 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.64 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.37 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.68 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  36.88 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.66 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.2 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.2 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.69 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  32.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  32.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  32.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  32.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  32.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  32.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.69 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  32.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>