17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1267 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1267  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  239  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0268  hypothetical protein  68 
 
 
125 aa  167  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2100  hypothetical protein  44.8 
 
 
137 aa  104  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000863796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0998  hypothetical protein  38.64 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000201016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2965  hypothetical protein  42.75 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  hitchhiker  0.0000133236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3147  hypothetical protein  41.22 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0376  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34090  predicted membrane protein  32.69 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1934  protein of unknown function DUF307  32.41 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00173836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4171  protein of unknown function DUF307  28.7 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.974051  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1698  protein of unknown function DUF307  28.7 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.888972  hitchhiker  0.00956065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6422  hypothetical protein  29.36 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174241  normal  0.798196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10870  predicted membrane protein  27.88 
 
 
130 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4052  protein of unknown function DUF307  28.44 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5046  hypothetical protein  30.28 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2804  protein of unknown function DUF307  26.42 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219169  normal  0.220669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1882  hypothetical protein  27.36 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>