More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1252 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 
143 aa  290  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  85.29 
 
 
163 aa  239  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  80.45 
 
 
139 aa  225  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  79.56 
 
 
143 aa  222  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  74.63 
 
 
140 aa  204  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  49.14 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.63 
 
 
137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.53 
 
 
130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.86 
 
 
142 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.68 
 
 
132 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.98 
 
 
132 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  40.6 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.38 
 
 
148 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.62 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  35.26 
 
 
162 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  38.17 
 
 
140 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  38.76 
 
 
158 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.76 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  40.62 
 
 
150 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  34.64 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  39.68 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  36.57 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.07 
 
 
207 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  39.81 
 
 
161 aa  84.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  39.68 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.4 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.94 
 
 
151 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.48 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.68 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.52 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.16 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.16 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.31 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.3 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.61 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  37.96 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  32.28 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.29 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  37.61 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.22 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.21 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.59 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  34.29 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  33.64 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.17 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  35.56 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.11 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.11 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.27 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.88 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.43 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  37.78 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  32.54 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.09 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.16 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  35.56 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  35.43 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.81 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  33.86 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  30.56 
 
 
211 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  30.71 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  33.04 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.62 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.88 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  30.4 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.89 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  33.09 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  38.39 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.56 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  30.33 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  35.56 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.11 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.65 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  32.14 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.56 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  29.69 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  36.81 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  31.13 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  31.75 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.43 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  31.43 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  33.63 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.65 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  33.33 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  33.04 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>