More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1214 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 		 357 aa  707    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  70.87 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  47.9 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.88 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.46 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.29 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.46 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.37 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.63 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.22 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.67 
 
 		 357 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.22 
 
 		 355 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  47.06 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  46.69 
 
 		 358 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.53 
 
 		 354 aa  322  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.96 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.86 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.96 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.08 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.86 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.51 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.98 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.55 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.46 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.13 
 
 		 355 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.85 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.77 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.46 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.18 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.92 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.58 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.78 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.37 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.98 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.5 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.94 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.1 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.44 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.21 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.21 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.79 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.88 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  40.6 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  32.35 
 
 		 399 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.45 
 
 		 245 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.45 
 
 		 245 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.45 
 
 		 245 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.03 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.03 
 
 		 245 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.45 
 
 		 245 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  41.03 
 
 		 245 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  41.45 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.03 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  29.89 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  31.27 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.56 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  41 
 
 		 244 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.72 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.73 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  31.87 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0937  nucleotidyl transferase  38.46 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.44 
 
 		 353 aa  176  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 		 299 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  40.76 
 
 		 235 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  32.93 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  38.4 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.15 
 
 		 240 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 		 289 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  31.32 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  30.41 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  41.48 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  31.29 
 
 		 411 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  36.5 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.33 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  37.82 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.57 
 
 		 292 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0416  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  38.78 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.75 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0826  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.13 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0797  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.13 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.54 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0504  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0219924  normal  0.028839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>