More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1084 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  65.32 
 
 		 699 aa  867    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2645  NAD-dependent DNA ligase LigA  64.5 
 
 		 710 aa  853    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  71.43 
 
 		 693 aa  976    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 700 aa  1393    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  66.62 
 
 		 692 aa  891    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  45.7 
 
 		 675 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  50.44 
 
 		 673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.79 
 
 		 673 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  45.29 
 
 		 690 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  47.05 
 
 		 675 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  48.21 
 
 		 685 aa  555  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.98 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  45.96 
 
 		 685 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  47.72 
 
 		 673 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  45.08 
 
 		 674 aa  545  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  45.86 
 
 		 670 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  47.18 
 
 		 711 aa  542  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  47.27 
 
 		 669 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 683 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  45.64 
 
 		 670 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 		 677 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  45.35 
 
 		 685 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  46.57 
 
 		 711 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  45.2 
 
 		 685 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.27 
 
 		 690 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  45.29 
 
 		 670 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  45.35 
 
 		 685 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  45.04 
 
 		 689 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.1 
 
 		 670 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  44.03 
 
 		 672 aa  535  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 		 691 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  46.9 
 
 		 681 aa  532  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.58 
 
 		 670 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.43 
 
 		 670 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  44.84 
 
 		 668 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  46.62 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  44.97 
 
 		 690 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.58 
 
 		 670 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  44.84 
 
 		 668 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  45.74 
 
 		 668 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.43 
 
 		 682 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  47.56 
 
 		 678 aa  528  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  44.59 
 
 		 670 aa  525  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.71 
 
 		 669 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.99 
 
 		 721 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 670 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  43.24 
 
 		 662 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  43.62 
 
 		 672 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.64 
 
 		 684 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  46.76 
 
 		 693 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  46.5 
 
 		 666 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 706 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.49 
 
 		 697 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  45.17 
 
 		 671 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  38.32 
 
 		 662 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  44.54 
 
 		 694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  43.97 
 
 		 672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  44.2 
 
 		 690 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  44.88 
 
 		 693 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.82 
 
 		 673 aa  513  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  45.26 
 
 		 683 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  43.89 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  43.28 
 
 		 677 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.66 
 
 		 671 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  44.64 
 
 		 683 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.93 
 
 		 670 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  41.8 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.88 
 
 		 681 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  44.85 
 
 		 707 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.67 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  45.27 
 
 		 671 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.01 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  43.01 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.01 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  45.12 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  44.63 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.45 
 
 		 681 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  44.63 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.01 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  43.01 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.01 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  44.23 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.01 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.88 
 
 		 671 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  44.54 
 
 		 682 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  44.41 
 
 		 700 aa  502  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  41.34 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.88 
 
 		 671 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.88 
 
 		 671 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.01 
 
 		 671 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.5 
 
 		 671 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  44.23 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  44.23 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.08 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.03 
 
 		 670 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.88 
 
 		 671 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>