More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1023 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.25 
 
 
261 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.42 
 
 
262 aa  331  6e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 
261 aa  322  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.87 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.24 
 
 
261 aa  299  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
262 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
262 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
261 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
263 aa  172  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
267 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
260 aa  171  9e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
259 aa  169  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
264 aa  168  9e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
262 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
259 aa  165  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
261 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
248 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
271 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
260 aa  159  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
261 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
260 aa  153  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
260 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
266 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
261 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
255 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
294 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  33.98 
 
 
258 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
259 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
260 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
264 aa  131  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
362 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
265 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.36 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
259 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
259 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
276 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
265 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  33.98 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
258 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298877  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
260 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
259 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 
268 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
259 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.5 
 
 
325 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 
269 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
262 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
260 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
247 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
264 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719452  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
261 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
260 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
253 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2540  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
258 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
253 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>