220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1012 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  306  5e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  65.61 
 
 
149 aa  186  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  63.06 
 
 
148 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  59.24 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  57.43 
 
 
154 aa  157  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  47.13 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  48.12 
 
 
162 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  47.47 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  40.67 
 
 
154 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  45.86 
 
 
162 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  45.86 
 
 
159 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  38.71 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  40.38 
 
 
157 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  48.44 
 
 
199 aa  95.1  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  40.52 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  37.97 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  41.73 
 
 
182 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  36.84 
 
 
168 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.57 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  41.41 
 
 
184 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  43.31 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.93 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  33.13 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  45.81 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  31.36 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  38.22 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  38.71 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  33.91 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  30.54 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  30.54 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  39.26 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  39.17 
 
 
332 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.59 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  39.34 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.5 
 
 
260 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.5 
 
 
280 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  33.83 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  36.67 
 
 
289 aa  60.5  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  32.5 
 
 
273 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  36.97 
 
 
252 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  35.83 
 
 
258 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  34.45 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  36.97 
 
 
252 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  30.41 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  36.97 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  36.97 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  36.67 
 
 
241 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  36.67 
 
 
262 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  36.97 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  30.41 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  37.01 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  37.01 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35.83 
 
 
263 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  37.01 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.33 
 
 
266 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  41.09 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  36.13 
 
 
249 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  35.25 
 
 
245 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  35 
 
 
248 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.83 
 
 
267 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  36.13 
 
 
252 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  35.29 
 
 
247 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  36.13 
 
 
252 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  34.17 
 
 
263 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  35.29 
 
 
218 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  33.71 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  36.67 
 
 
241 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  36.79 
 
 
255 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  35.29 
 
 
249 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  35.29 
 
 
249 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  35.25 
 
 
240 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  40.95 
 
 
275 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  35 
 
 
264 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.3 
 
 
186 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.3 
 
 
186 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  35.29 
 
 
244 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  35.29 
 
 
244 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  35.29 
 
 
244 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  35.29 
 
 
247 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  35.29 
 
 
244 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  35.29 
 
 
244 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  31.67 
 
 
225 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  34.43 
 
 
245 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  34.51 
 
 
266 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  36.67 
 
 
279 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  32.79 
 
 
245 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.78 
 
 
288 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  31.67 
 
 
216 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  40.62 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  36.67 
 
 
268 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  35 
 
 
278 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  36.67 
 
 
283 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  34.17 
 
 
266 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  31.32 
 
 
241 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  34.17 
 
 
267 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  36.13 
 
 
241 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  32.79 
 
 
245 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  33.04 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>