More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0971 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  74.91 
 
 		 554 aa  790    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  100 
 
 		 552 aa  1083    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  66.73 
 
 		 555 aa  702    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  75.71 
 
 		 561 aa  777    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  74.15 
 
 		 548 aa  749    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  60.53 
 
 		 559 aa  594  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  60.34 
 
 		 558 aa  591  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  58.16 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  59.46 
 
 		 563 aa  566  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  55.43 
 
 		 543 aa  566  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  54.68 
 
 		 542 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  53.65 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  53.46 
 
 		 542 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  52.52 
 
 		 543 aa  543  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  53.16 
 
 		 539 aa  543  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  53.46 
 
 		 542 aa  544  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  50.64 
 
 		 543 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  51.12 
 
 		 555 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  53.12 
 
 		 543 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  56.49 
 
 		 553 aa  537  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  54.7 
 
 		 551 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  57.97 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  54.11 
 
 		 551 aa  528  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  49.81 
 
 		 551 aa  519  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  54.13 
 
 		 552 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  54.13 
 
 		 552 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  47.71 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  50.29 
 
 		 547 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  49.81 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  47.99 
 
 		 545 aa  478  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  47.83 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  46.72 
 
 		 570 aa  477  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  45.7 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  46.58 
 
 		 557 aa  466  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  45.89 
 
 		 553 aa  465  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.63 
 
 		 530 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  48.18 
 
 		 500 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.63 
 
 		 536 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  46.29 
 
 		 562 aa  461  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.26 
 
 		 546 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  42.66 
 
 		 540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  48.76 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.98 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  47.89 
 
 		 548 aa  444  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.95 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  48 
 
 		 525 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  48 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.63 
 
 		 519 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.6 
 
 		 532 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  44.83 
 
 		 558 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  44.25 
 
 		 560 aa  427  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  47.89 
 
 		 554 aa  426  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  48.28 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  44.89 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.15 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.99 
 
 		 525 aa  418  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  42.61 
 
 		 547 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  40.77 
 
 		 558 aa  418  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  44.25 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  44 
 
 		 537 aa  412  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  38.68 
 
 		 528 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  39.65 
 
 		 535 aa  364  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  35.77 
 
 		 538 aa  340  4e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  34.1 
 
 		 527 aa  324  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  37.65 
 
 		 535 aa  323  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  36.24 
 
 		 553 aa  320  3.9999999999999996e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  33.89 
 
 		 567 aa  317  5e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  36.36 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  36.77 
 
 		 550 aa  313  3.9999999999999997e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  35.88 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  35.73 
 
 		 558 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  33.76 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  35.67 
 
 		 542 aa  306  5.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.45 
 
 		 568 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  36.01 
 
 		 541 aa  306  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  33.65 
 
 		 570 aa  303  8.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  34.77 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.56 
 
 		 536 aa  301  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.36 
 
 		 551 aa  300  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  35.52 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  34.27 
 
 		 536 aa  296  8e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  35.53 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  33.53 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  33.53 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.47 
 
 		 560 aa  286  5e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  33.52 
 
 		 548 aa  286  7e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  34.85 
 
 		 577 aa  283  8.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  32.85 
 
 		 563 aa  273  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  34.23 
 
 		 530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  32.54 
 
 		 539 aa  263  8.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.03 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.46 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  32.45 
 
 		 558 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.4 
 
 		 523 aa  260  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  34.5 
 
 		 534 aa  250  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  34.5 
 
 		 534 aa  250  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.45 
 
 		 564 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  31.05 
 
 		 547 aa  242  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  31.63 
 
 		 541 aa  238  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.14 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>