More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0944 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 433 aa  886    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  29.8 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.82 
 
 		 366 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.19 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 411 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.12 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  24.22 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.87 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.87 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  27.81 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.44 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.69 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 461 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.04 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.43 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 486 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.66 
 
 		 403 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.24 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  20.51 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0113  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.270734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.82 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>