112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0902 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 351 aa  702    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  48.3 
 
 		 350 aa  305  7e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  47.58 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  44.71 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  45.91 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  30.15 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  26.36 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  27.01 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  28.62 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  28.62 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  25.55 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  26.18 
 
 		 470 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  26.5 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  27.47 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  32.03 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  24.16 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  24.17 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  30.77 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.5 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  27.8 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  27.33 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  23.75 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  28.68 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  29.92 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  27.92 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  27.92 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  28.08 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  34.51 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  26.62 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  30.49 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  30.49 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.96 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  26.83 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.33 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  26.43 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  26.43 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  26.43 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  34.51 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  26.43 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  26.43 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  26.43 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  24.45 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  26.81 
 
 		 564 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  33.8 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  28 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  21.46 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  27.1 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  27.24 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  29.73 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  29.73 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.38 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  34.51 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.27 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  26.96 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25.87 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  27.6 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.48 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.87 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  32.54 
 
 		 355 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  28.33 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  25.12 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  25.41 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  28.83 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  27.1 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  25.56 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  25.58 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  32.28 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  29.73 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  26.67 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.64 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  28.44 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.33 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  28.44 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.11 
 
 		 337 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  30.13 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  26.05 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.87 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  26.83 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  35.65 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  28.44 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  25.34 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  25.34 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  26.7 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.96 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  29.49 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  25.19 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  27.14 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  31.82 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  26.41 
 
 		 310 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.32 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  26.34 
 
 		 300 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  20.97 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  26.83 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  28.18 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  29.85 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.18 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.98 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  39.24 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  35.79 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>