237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0876 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
203 aa  400  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  71.21 
 
 
203 aa  284  7e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  71.5 
 
 
204 aa  278  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  66.98 
 
 
216 aa  268  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  67.48 
 
 
210 aa  259  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  67.18 
 
 
211 aa  256  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  38.42 
 
 
207 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  40.31 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.16 
 
 
212 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.83 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  37.63 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  33.17 
 
 
205 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.16 
 
 
221 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  36.73 
 
 
211 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.17 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  37.44 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  45.89 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  36.17 
 
 
206 aa  124  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  30.57 
 
 
197 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.83 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  40.12 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  32.83 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  32.83 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  42.76 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  36.08 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.32 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  32.32 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.32 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  33.88 
 
 
192 aa  118  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.51 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  31.82 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  39.46 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.32 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  34.38 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.01 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  32.09 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  34.52 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.2 
 
 
205 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.92 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  35.79 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  37.1 
 
 
222 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  36.7 
 
 
197 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.61 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  37.91 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  38.92 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  33.67 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  36.75 
 
 
172 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.29 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  35 
 
 
245 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  35.82 
 
 
216 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  40.51 
 
 
192 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  34.5 
 
 
213 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  29.44 
 
 
212 aa  106  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  35.67 
 
 
205 aa  105  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.61 
 
 
194 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  32.18 
 
 
210 aa  104  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  36.07 
 
 
239 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.5 
 
 
210 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.12 
 
 
211 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  37.44 
 
 
225 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  38.97 
 
 
206 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  31.22 
 
 
207 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  34.25 
 
 
195 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  30.51 
 
 
194 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  36.81 
 
 
206 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  35.68 
 
 
200 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  34.5 
 
 
206 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  34.3 
 
 
214 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  36.16 
 
 
213 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  34.25 
 
 
195 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  35.14 
 
 
212 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 
212 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  36.16 
 
 
213 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  38.61 
 
 
191 aa  101  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  34.81 
 
 
195 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  34.81 
 
 
195 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  34.81 
 
 
195 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  35.9 
 
 
204 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  34.41 
 
 
195 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  34.25 
 
 
195 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  35.87 
 
 
290 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  33.7 
 
 
195 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  36.42 
 
 
212 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  29.14 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.59 
 
 
194 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  34.59 
 
 
194 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  34.05 
 
 
190 aa  99  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  35.96 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  34.93 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>