More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0872 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  100 
 
 
229 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  65 
 
 
338 aa  289  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  66.82 
 
 
356 aa  279  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  62.91 
 
 
371 aa  277  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  58.06 
 
 
360 aa  246  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  56.44 
 
 
307 aa  236  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  45.41 
 
 
305 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2612  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
314 aa  178  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  45.97 
 
 
316 aa  174  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  43.54 
 
 
301 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  44.76 
 
 
334 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  40.72 
 
 
332 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  40.18 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
251 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.78 
 
 
309 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  37.14 
 
 
320 aa  151  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  38.65 
 
 
243 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  37.56 
 
 
242 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 
244 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  39.71 
 
 
332 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.65 
 
 
309 aa  149  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  40.29 
 
 
244 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.2 
 
 
325 aa  148  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  40.78 
 
 
244 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  40.78 
 
 
244 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  40.78 
 
 
244 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  37.75 
 
 
241 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  40.82 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  40.29 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  38.54 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.16 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  40.29 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  40.29 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  40.29 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.19 
 
 
369 aa  145  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
305 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  41.54 
 
 
270 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 
249 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  40 
 
 
328 aa  142  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 
321 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
309 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  37.8 
 
 
244 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  38.35 
 
 
244 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.54 
 
 
314 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 
312 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
301 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 
242 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  38.83 
 
 
244 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  38.58 
 
 
305 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
318 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.41 
 
 
305 aa  141  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 
305 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  41.18 
 
 
300 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
305 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  38.94 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  37.09 
 
 
334 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
305 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
248 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  37.44 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  38.1 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.71 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  38.1 
 
 
248 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 
305 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  41.04 
 
 
457 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.09 
 
 
368 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.01 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1411  ABC-type transport system, ATPase component  33.01 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715833  unclonable  3.14e-28 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.2 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  36.79 
 
 
273 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  36.45 
 
 
312 aa  138  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 
306 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  40.87 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  38.43 
 
 
307 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  36.45 
 
 
512 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 
312 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  37.38 
 
 
244 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 
259 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.68 
 
 
333 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.35 
 
 
244 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.44 
 
 
282 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.98 
 
 
317 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 
330 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.79 
 
 
320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  39.45 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.23 
 
 
315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  39.25 
 
 
328 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  35.44 
 
 
306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 
306 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  36.98 
 
 
257 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.97 
 
 
334 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>