More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0837 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 
378 aa  775    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  67.89 
 
 
382 aa  548  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  68.15 
 
 
382 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  67.28 
 
 
379 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  65.97 
 
 
382 aa  527  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  56.8 
 
 
377 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  54.57 
 
 
371 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  53.76 
 
 
382 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  54.03 
 
 
371 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  53.76 
 
 
371 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  53.76 
 
 
371 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  53.76 
 
 
371 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  54.03 
 
 
382 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  53.76 
 
 
371 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  53.76 
 
 
382 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  54.03 
 
 
382 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  53.23 
 
 
386 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  52.27 
 
 
372 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  51.73 
 
 
372 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  50.94 
 
 
380 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  48.28 
 
 
373 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.51 
 
 
430 aa  356  5e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  46.44 
 
 
373 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  46.44 
 
 
373 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.73 
 
 
385 aa  350  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  47.88 
 
 
373 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.09 
 
 
373 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  45.84 
 
 
374 aa  340  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.56 
 
 
377 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.71 
 
 
379 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.56 
 
 
397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.51 
 
 
393 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  42.52 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.2 
 
 
375 aa  315  9e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.74 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  45 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.86 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.18 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  44.59 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  41.73 
 
 
395 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  43.65 
 
 
412 aa  311  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  44.33 
 
 
381 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.89 
 
 
378 aa  309  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  44.33 
 
 
381 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.86 
 
 
387 aa  308  8e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  42.93 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  44.06 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  44.62 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.89 
 
 
409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  44.21 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  44.44 
 
 
396 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.31 
 
 
409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  43.68 
 
 
386 aa  302  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  43.72 
 
 
375 aa  301  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  42.56 
 
 
389 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  44.59 
 
 
396 aa  301  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  43.68 
 
 
375 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  41.65 
 
 
397 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  41.87 
 
 
386 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  42.71 
 
 
386 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  41.87 
 
 
386 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  42.71 
 
 
386 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  43.81 
 
 
387 aa  299  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.16 
 
 
404 aa  299  5e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.25 
 
 
372 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.87 
 
 
374 aa  296  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  41.22 
 
 
379 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  41.69 
 
 
378 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  42.51 
 
 
372 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  42.09 
 
 
372 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  41.15 
 
 
377 aa  292  6e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.68 
 
 
367 aa  292  7e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.68 
 
 
367 aa  292  7e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  40.5 
 
 
393 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  43.19 
 
 
391 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  43.09 
 
 
373 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  40.56 
 
 
372 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  43.57 
 
 
389 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  43.87 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  40.32 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  41.87 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  39.45 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  39.45 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  39.45 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  39.45 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  39.45 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  39.45 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  41.01 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  39.45 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  41.53 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  39.36 
 
 
375 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  41.98 
 
 
377 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  40.59 
 
 
378 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  40 
 
 
372 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  38.98 
 
 
375 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  39.63 
 
 
375 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.98 
 
 
374 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  38.98 
 
 
375 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  43.15 
 
 
374 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  39.45 
 
 
373 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>