More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0789 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  726    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  53.75 
 
 
338 aa  340  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  50.61 
 
 
371 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  52.02 
 
 
356 aa  316  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  51.65 
 
 
307 aa  264  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  58.06 
 
 
229 aa  246  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  38.85 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2612  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
314 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  35.4 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  35.09 
 
 
316 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  35.37 
 
 
301 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  31.53 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  34.66 
 
 
327 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
330 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  36.74 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  34.01 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  32.08 
 
 
331 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  36.28 
 
 
334 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.96 
 
 
312 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  32.37 
 
 
335 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.38 
 
 
309 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  37.29 
 
 
323 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  31.4 
 
 
327 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.9 
 
 
309 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  35.68 
 
 
337 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
328 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  32.59 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.36 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.82 
 
 
325 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  32.56 
 
 
315 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
337 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  36.86 
 
 
328 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
309 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  33.04 
 
 
326 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.13 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  33.23 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  39.65 
 
 
325 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.75 
 
 
305 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1411  ABC-type transport system, ATPase component  33.47 
 
 
317 aa  153  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715833  unclonable  3.14e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
304 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  36.22 
 
 
326 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.7 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  30.48 
 
 
328 aa  153  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
318 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  39.11 
 
 
270 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  32.3 
 
 
327 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  34.74 
 
 
337 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.46 
 
 
411 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.76 
 
 
321 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.27 
 
 
368 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  33.02 
 
 
318 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  34.39 
 
 
299 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  32.07 
 
 
329 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  34.07 
 
 
310 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  35.13 
 
 
339 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  33.33 
 
 
314 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  37.06 
 
 
310 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  37.19 
 
 
599 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  37.44 
 
 
330 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 
339 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.08 
 
 
318 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  30.28 
 
 
320 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  33.12 
 
 
320 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  30.28 
 
 
320 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  31.46 
 
 
319 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  33.96 
 
 
310 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  34.17 
 
 
328 aa  150  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.52 
 
 
345 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.97 
 
 
317 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  37.33 
 
 
336 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  32.12 
 
 
334 aa  149  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  32.81 
 
 
325 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
333 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 
306 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.39 
 
 
321 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  39.38 
 
 
305 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  33.74 
 
 
242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  34.07 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.77 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  39.17 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  34.91 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.9 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  34.91 
 
 
308 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  36.78 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  37.8 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  31.52 
 
 
323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  40.38 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  30.7 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>