295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0593 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  77.14 
 
 
243 aa  388  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  77.88 
 
 
229 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  71.49 
 
 
251 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  52.27 
 
 
222 aa  244  1e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  54.34 
 
 
220 aa  244  1e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  51.33 
 
 
226 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  52.94 
 
 
221 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  50.43 
 
 
258 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  50.44 
 
 
226 aa  235  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  50.22 
 
 
227 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  50.22 
 
 
226 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  50.22 
 
 
226 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  49.1 
 
 
222 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  47.93 
 
 
218 aa  213  3e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  48.66 
 
 
257 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  43.84 
 
 
220 aa  201  1e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  42.53 
 
 
223 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  43.38 
 
 
223 aa  185  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  40.45 
 
 
224 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  43.04 
 
 
227 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  43.1 
 
 
237 aa  175  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  41.41 
 
 
229 aa  174  1e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  42.79 
 
 
225 aa  173  2e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  42.33 
 
 
225 aa  172  4e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  38.64 
 
 
221 aa  171  8e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  43.5 
 
 
222 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  38.74 
 
 
224 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  42.11 
 
 
233 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  42.79 
 
 
230 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  38.57 
 
 
224 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  38.12 
 
 
224 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  37.56 
 
 
221 aa  168  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  40.62 
 
 
222 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  42.48 
 
 
224 aa  163  4e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  39.47 
 
 
244 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  41.99 
 
 
230 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  41.15 
 
 
225 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  41.67 
 
 
225 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  42.29 
 
 
228 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  38.52 
 
 
259 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  41.23 
 
 
225 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  38.52 
 
 
285 aa  155  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  40.87 
 
 
233 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  42.29 
 
 
228 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  39.91 
 
 
226 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  39.04 
 
 
226 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  37.16 
 
 
225 aa  153  3e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  37.16 
 
 
225 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  40.26 
 
 
228 aa  152  6e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  43.52 
 
 
231 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  37 
 
 
232 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  40.34 
 
 
241 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  40.79 
 
 
226 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  39.74 
 
 
228 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  32.91 
 
 
484 aa  149  7e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  41.41 
 
 
237 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  36.86 
 
 
256 aa  148  1e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  39.57 
 
 
225 aa  147  1e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  40.43 
 
 
224 aa  147  1e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  40.43 
 
 
230 aa  147  1e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  40.43 
 
 
229 aa  147  2e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.53404e-08  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  41.23 
 
 
227 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.8435e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  39.08 
 
 
234 aa  146  4e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  40.43 
 
 
230 aa  146  4e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  40 
 
 
229 aa  146  4e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  39.08 
 
 
234 aa  146  4e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  39.82 
 
 
223 aa  146  4e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.26628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  38.84 
 
 
226 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  40.81 
 
 
223 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  37.83 
 
 
246 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  40 
 
 
232 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  40.71 
 
 
224 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  38.86 
 
 
229 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  38.66 
 
 
234 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  34.51 
 
 
229 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  34.36 
 
 
221 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  38.32 
 
 
222 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.18958e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  36.62 
 
 
224 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  41.59 
 
 
224 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  38.14 
 
 
235 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  40.53 
 
 
221 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  39.38 
 
 
237 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  40.09 
 
 
236 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  39.47 
 
 
228 aa  141  1e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  39.38 
 
 
224 aa  141  1e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  37.07 
 
 
234 aa  140  2e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  40 
 
 
227 aa  140  2e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  40.27 
 
 
229 aa  140  2e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  36.62 
 
 
224 aa  140  2e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  36.79 
 
 
224 aa  140  2e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  38.79 
 
 
229 aa  140  2e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  38.12 
 
 
224 aa  140  2e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  38.6 
 
 
228 aa  140  2e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  40.44 
 
 
224 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  38.84 
 
 
230 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  40.27 
 
 
224 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  39.04 
 
 
224 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  39.04 
 
 
224 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  37.67 
 
 
226 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>