More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0591 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  100 
 
 
258 aa  520  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  67.57 
 
 
258 aa  358  4e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  65.36 
 
 
280 aa  351  7e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  72.13 
 
 
274 aa  342  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  41.47 
 
 
260 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  33.2 
 
 
215 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 
216 aa  109  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  32.51 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
208 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  31.82 
 
 
215 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 
216 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
215 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 
209 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 
215 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 
230 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  30.77 
 
 
227 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  32.08 
 
 
216 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  33.33 
 
 
215 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  32.1 
 
 
217 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  32.92 
 
 
215 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  34.77 
 
 
247 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 
233 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 
217 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  33.75 
 
 
264 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  32.92 
 
 
215 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 
227 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  32.33 
 
 
210 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  28.78 
 
 
256 aa  102  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  32.5 
 
 
213 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
226 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  34.16 
 
 
217 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  33.2 
 
 
223 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
247 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  34.54 
 
 
216 aa  98.6  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.85 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  32.11 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  31.09 
 
 
216 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  38.64 
 
 
223 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  42.99 
 
 
212 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
213 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  32.94 
 
 
213 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  38.07 
 
 
223 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  43.93 
 
 
215 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  32.57 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  42.03 
 
 
224 aa  95.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  40.15 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 
223 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  40.3 
 
 
197 aa  93.6  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 
213 aa  92.8  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  46.79 
 
 
210 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 
211 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  44.34 
 
 
210 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 
220 aa  92  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  39.86 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 
195 aa  91.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  31.93 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  34.1 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  43.7 
 
 
235 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  37.23 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  37.23 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  36.55 
 
 
222 aa  89.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  24.81 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  42.61 
 
 
202 aa  89  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  35.44 
 
 
245 aa  89  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  35.33 
 
 
226 aa  89  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  32.89 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 
225 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  32.57 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  41.67 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 
210 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 
210 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  36.96 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  36.5 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  40.44 
 
 
212 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>