More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0378 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 411 aa  833    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  73.66 
 
 		 411 aa  649    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  70.75 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  66.74 
 
 		 432 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  67.63 
 
 		 414 aa  568  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  41.49 
 
 		 411 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  39.7 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.17 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  34.28 
 
 		 422 aa  240  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 421 aa  239  8e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  35.95 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 821 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 642 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.66 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  31.02 
 
 		 637 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 630 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 639 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 		 426 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 		 635 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  31.5 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.8 
 
 		 636 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 635 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  31.67 
 
 		 636 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.51 
 
 		 644 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 		 630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 635 aa  173  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 640 aa  172  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 635 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  31.59 
 
 		 635 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 634 aa  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 635 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 641 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.05 
 
 		 644 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 639 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.44 
 
 		 647 aa  167  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 641 aa  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 646 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 		 830 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 634 aa  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 634 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  29.98 
 
 		 636 aa  152  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 577 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 468 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 667 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 652 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  28.91 
 
 		 453 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.17 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  28.07 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  28.07 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  27.35 
 
 		 467 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 		 457 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.75 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.58 
 
 		 530 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  31.25 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.99 
 
 		 543 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 589 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  29.39 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 464 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  28.64 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  27.04 
 
 		 793 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  30.15 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.06 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  27.82 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.68 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 515 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 		 536 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  28.41 
 
 		 813 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 461 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  28.5 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 473 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>