More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0358 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  54.75 
 
 		 956 aa  879    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 		 871 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  61.34 
 
 		 917 aa  1064    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  46.03 
 
 		 853 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  64.51 
 
 		 865 aa  1093    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 932 aa  649    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 873 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 870 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  47.29 
 
 		 848 aa  664    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 869 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 887 aa  653    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 869 aa  647    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 867 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 		 896 aa  692    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  62.46 
 
 		 893 aa  1058    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 918 aa  1814    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 		 868 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.24 
 
 		 870 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 872 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 897 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.19 
 
 		 910 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 881 aa  633  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.33 
 
 		 863 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 872 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.19 
 
 		 910 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 		 865 aa  631  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 		 857 aa  627  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 853 aa  624  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 		 903 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 		 860 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.08 
 
 		 857 aa  620  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 		 872 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 		 863 aa  615  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 889 aa  615  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 		 872 aa  608  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 		 895 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.01 
 
 		 900 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  39.2 
 
 		 837 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 		 872 aa  608  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  38.76 
 
 		 892 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 890 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  38.76 
 
 		 892 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 		 890 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 		 894 aa  602  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 870 aa  602  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 		 891 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  38.36 
 
 		 892 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  38.54 
 
 		 892 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  36.09 
 
 		 873 aa  598  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  37.99 
 
 		 892 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 882 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 862 aa  598  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 892 aa  594  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 		 890 aa  594  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  47.15 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 		 850 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.58 
 
 		 859 aa  592  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 		 892 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 		 819 aa  582  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  38.29 
 
 		 828 aa  579  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 895 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 840 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 880 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 872 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  36.34 
 
 		 852 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 878 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 793 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 		 861 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 		 868 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 		 888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 		 888 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 		 817 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 868 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.74 
 
 		 875 aa  562  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 		 874 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 		 898 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  38.17 
 
 		 896 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 		 858 aa  558  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 863 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 		 793 aa  559  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  44.02 
 
 		 882 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 		 887 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  32.97 
 
 		 848 aa  556  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 		 882 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 885 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  35.68 
 
 		 858 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  37.8 
 
 		 881 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 872 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 871 aa  553  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36.26 
 
 		 868 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 873 aa  551  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 882 aa  552  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 		 862 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 872 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 		 855 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  38.11 
 
 		 901 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  36.54 
 
 		 854 aa  550  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>