216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0269 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
361 aa  725  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  68.61 
 
 
362 aa  500  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  71.39 
 
 
360 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  68.52 
 
 
361 aa  495  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  68.78 
 
 
369 aa  475  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 
376 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 
384 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.79 
 
 
382 aa  115  1e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
399 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 
388 aa  110  4e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
375 aa  110  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  32.68 
 
 
385 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  29.15 
 
 
416 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 
365 aa  89.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  22.99 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 
386 aa  84.7  2e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 
378 aa  85.1  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 
392 aa  85.1  2e-15  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 
393 aa  84  4e-15  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
396 aa  83.6  5e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 
396 aa  83.6  6e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 
385 aa  81.6  2e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.46 
 
 
396 aa  79.7  7e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 
375 aa  79  1e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 
406 aa  76.6  5e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  22.99 
 
 
379 aa  76.3  7e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 
376 aa  75.1  2e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 
341 aa  74.3  3e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 
395 aa  73.2  6e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 
391 aa  72.8  1e-11  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 
387 aa  71.6  2e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 
398 aa  71.2  3e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.77 
 
 
379 aa  70.1  5e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  30.1 
 
 
375 aa  68.9  1e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
362 aa  67.8  3e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 
407 aa  67.4  4e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  23.8 
 
 
414 aa  66.2  9e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.79 
 
 
390 aa  65.1  2e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25 
 
 
378 aa  64.3  3e-09  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 
397 aa  63.5  5e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 
430 aa  63.5  5e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.13 
 
 
390 aa  63.5  6e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  31.36 
 
 
397 aa  62.8  8e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 
403 aa  62.8  9e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
402 aa  62.8  9e-09  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
398 aa  62.4  1e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 
424 aa  62.4  1e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  24.92 
 
 
415 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 
413 aa  61.6  2e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 
363 aa  61.2  2e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 
390 aa  60.8  3e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  27.69 
 
 
477 aa  60.8  3e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 
384 aa  60.8  3e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 
452 aa  60.8  3e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 
380 aa  60.8  3e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  23.12 
 
 
377 aa  60.5  4e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 
380 aa  60.5  5e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  26.47 
 
 
358 aa  60.1  6e-08  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  23.8 
 
 
356 aa  59.3  9e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 
431 aa  58.5  2e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  31.79 
 
 
479 aa  58.2  2e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  23.12 
 
 
424 aa  57.8  3e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  20.36 
 
 
391 aa  57.4  3e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  28.49 
 
 
363 aa  57.4  4e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  28.74 
 
 
403 aa  57  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  27.39 
 
 
394 aa  57.4  4e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  25.3 
 
 
415 aa  57.4  4e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 
394 aa  57.4  4e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1820  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.48 
 
 
419 aa  57  5e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00177812  hitchhiker  1.75067e-09 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  21.43 
 
 
390 aa  56.2  7e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 
453 aa  56.2  8e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  25.34 
 
 
379 aa  56.2  9e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.33 
 
 
377 aa  55.8  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  22.22 
 
 
377 aa  55.5  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24.41 
 
 
385 aa  54.7  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 
384 aa  55.1  2e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.07 
 
 
409 aa  55.5  2e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 
374 aa  55.1  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
418 aa  55.5  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 
402 aa  55.1  2e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  30.91 
 
 
486 aa  55.5  2e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  28.34 
 
 
360 aa  55.5  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  20.45 
 
 
377 aa  55.1  2e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 
430 aa  54.7  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 
397 aa  55.1  2e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  21.71 
 
 
376 aa  54.3  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  27.33 
 
 
466 aa  54.3  3e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 
399 aa  54.3  3e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  20.65 
 
 
370 aa  54.3  3e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  22.22 
 
 
535 aa  53.9  4e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 
405 aa  53.9  4e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 
368 aa  54.3  4e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
431 aa  53.5  5e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  28.82 
 
 
479 aa  53.5  6e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
545 aa  53.1  7e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
406 aa  52.8  9e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  28.67 
 
 
408 aa  52.8  9e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>