141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0187 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  50 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  51.45 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  53.23 
 
 
269 aa  260  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.94 
 
 
259 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.6 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.81 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.23 
 
 
267 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.14 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.67 
 
 
275 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.62 
 
 
276 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.62 
 
 
276 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  32.6 
 
 
276 aa  109  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  27.11 
 
 
245 aa  106  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.4 
 
 
266 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.19 
 
 
271 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.81 
 
 
240 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.24 
 
 
278 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.66 
 
 
261 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  26.6 
 
 
278 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  26.6 
 
 
278 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  26.24 
 
 
278 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  26.24 
 
 
278 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  26.24 
 
 
278 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  26.24 
 
 
278 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  26.24 
 
 
278 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  26.24 
 
 
278 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  26.24 
 
 
278 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.89 
 
 
278 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.96 
 
 
271 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.68 
 
 
268 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  30.04 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.79 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.73 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.61 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  29 
 
 
262 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  37.93 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.69 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.24 
 
 
245 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.74 
 
 
329 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.14 
 
 
255 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.22 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.51 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.08 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.17 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.35 
 
 
269 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.96 
 
 
272 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  32.47 
 
 
242 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  33.17 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.11 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.75 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.99 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.43 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.12 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.64 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  28.52 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  29.95 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.74 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.07 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  30.07 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  28.16 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  25.1 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.15 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.2 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  33.93 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.88 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.28 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.28 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  24.06 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  27.91 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  25.56 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.14 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  30.72 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.22 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.78 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  28.12 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  24.91 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.72 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.45 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  24.45 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  26.2 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.53 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.68 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  30.05 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.54 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  26.57 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  26.52 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  25.4 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  24.91 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.78 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.86 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>