More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0052 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  61.7 
 
 
590 aa  703    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
577 aa  1172    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  53.52 
 
 
552 aa  592  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  50 
 
 
557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  48.36 
 
 
562 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  48.19 
 
 
562 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  46.18 
 
 
558 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  46.18 
 
 
558 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  46.18 
 
 
558 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  46.86 
 
 
558 aa  544  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  46.01 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  45.83 
 
 
558 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  46.01 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  46.01 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  46.42 
 
 
554 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  45.31 
 
 
558 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  46.01 
 
 
558 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  46.77 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  46.33 
 
 
554 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  46.07 
 
 
554 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  45.9 
 
 
554 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  46.42 
 
 
554 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  46.07 
 
 
554 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  46.42 
 
 
554 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  46.42 
 
 
554 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  46.42 
 
 
554 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  46.42 
 
 
554 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  46.42 
 
 
554 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 
559 aa  527  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  49.47 
 
 
557 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  45.47 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.44 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  45.88 
 
 
555 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  45.71 
 
 
600 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  44.8 
 
 
568 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  46.68 
 
 
570 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  43.01 
 
 
554 aa  505  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  42.48 
 
 
554 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  46.75 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.31 
 
 
560 aa  494  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.91 
 
 
563 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  44.46 
 
 
556 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 
538 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.78 
 
 
560 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.96 
 
 
554 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  45.5 
 
 
578 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  43.08 
 
 
560 aa  478  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  46.06 
 
 
577 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  42.23 
 
 
582 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  42.31 
 
 
556 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  44.44 
 
 
606 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.81 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.41 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  41.3 
 
 
566 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  45.74 
 
 
555 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  42.8 
 
 
551 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.9 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.36 
 
 
561 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.37 
 
 
553 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  41.75 
 
 
554 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  42.76 
 
 
549 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  42.76 
 
 
549 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.26 
 
 
560 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.9 
 
 
553 aa  458  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  42.13 
 
 
561 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.91 
 
 
555 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.67 
 
 
562 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 
604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.37 
 
 
553 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.73 
 
 
553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  41.98 
 
 
622 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.61 
 
 
562 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.67 
 
 
553 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  40.67 
 
 
553 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  40.85 
 
 
553 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.02 
 
 
556 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.67 
 
 
553 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  43.08 
 
 
571 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.67 
 
 
553 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.14 
 
 
563 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.35 
 
 
551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.49 
 
 
551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  45.98 
 
 
596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.32 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  41.13 
 
 
551 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.13 
 
 
551 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.96 
 
 
551 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  44.3 
 
 
557 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.13 
 
 
551 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.07 
 
 
550 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.89 
 
 
550 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.07 
 
 
550 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  41 
 
 
551 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  41.13 
 
 
551 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.71 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.89 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.18 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  44.92 
 
 
571 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.06 
 
 
551 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.94 
 
 
546 aa  435  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>