More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0050 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 628 aa  1290    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  37.56 
 
 		 587 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  33.88 
 
 		 564 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  32.49 
 
 		 621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 603 aa  210  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 693 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 		 735 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 604 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.76 
 
 		 607 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 616 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 604 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 616 aa  94.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.69 
 
 		 609 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 675 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 		 579 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 		 615 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  23.46 
 
 		 587 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 775 aa  77.4  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.1 
 
 		 560 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 		 575 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  23.61 
 
 		 577 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.7 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  21.5 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 559 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 810 aa  74.3  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 551 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 510 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 788 aa  71.6  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2119  hypothetical protein  29.59 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  22.93 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  22.14 
 
 		 693 aa  70.9  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 533 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.86 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.88 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.8 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 		 580 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 557 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 589 aa  67  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 557 aa  67  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  21.36 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 595 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2237  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  24.87 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  21.98 
 
 		 545 aa  65.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  22.17 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.25 
 
 		 527 aa  64.3  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 787 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 810 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 565 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 540 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>