18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0013 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0013  RNA polymerase Rbp10  100 
 
 		 44 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.502015  normal  0.833667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1482  RNA polymerase Rbp10  95.45 
 
 		 44 aa  87  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2452  RNA polymerase Rbp10  95.45 
 
 		 44 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.474436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit P  90.91 
 
 		 44 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2673  DNA-directed RNA polymerase subunit P  88.64 
 
 		 44 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1359  DNA-directed RNA polymerase subunit P  66.67 
 
 		 45 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2509  DNA-directed RNA polymerase subunit P  55.56 
 
 		 45 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00614526  normal  0.337835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0202  DNA-directed RNA polymerase subunit P  58.7 
 
 		 46 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.51611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2285  DNA-directed RNA polymerase subunit P  53.49 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1819  DNA-directed RNA polymerase subunit P  53.49 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1675  DNA-directed RNA polymerase subunit P  48.84 
 
 		 43 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2523  DNA-directed RNA polymerase subunit P  51.16 
 
 		 44 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1857  DNA-directed RNA polymerase subunit P  45.45 
 
 		 43 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.201091  hitchhiker  0.00457594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0178  RNA polymerase Rbp10  46.67 
 
 		 46 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.486719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1250  RNA polymerase Rbp10  48.84 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0705  RNA polymerase Rbp10  48.84 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1425  DNA-directed RNA polymerase, subunit P  48.84 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1261  RNA polymerase Rbp10  48.84 
 
 		 46 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.875453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>