60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0045 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  95.74 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  95 
 
 		 104 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  88.33 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  88.33 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 94 bp  54  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0041  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.707776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.189298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  85 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 104 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06510  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000338303  normal  0.349036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0039  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000365945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0043  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0039  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0477837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0045  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0044  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0019  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>