15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0006 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0006  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000148153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0028  tRNA-Phe  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0010  tRNA-Phe  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0037  tRNA-Phe  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0011  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0040  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0002  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0054  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0017  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.011129  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0038  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0270674  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0026  tRNA-Phe  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000149355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0057  tRNA-Phe  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0046  tRNA-Phe  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0017  tRNA-Phe  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0058  tRNA-Phe  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.177326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>