More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3555 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3555  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
225 aa  443  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  57.96 
 
 
226 aa  251  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  57.96 
 
 
226 aa  242  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  57.4 
 
 
223 aa  241  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  55.56 
 
 
223 aa  236  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  54.5 
 
 
224 aa  234  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  52.25 
 
 
219 aa  211  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2346  phosphate uptake regulator, PhoU  54.91 
 
 
224 aa  210  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0506  phosphate uptake regulator, PhoU  49.79 
 
 
232 aa  207  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1788  phosphate uptake regulator, PhoU  48.2 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135594  normal  0.0168871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  48.26 
 
 
225 aa  193  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  43.36 
 
 
222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 
217 aa  121  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 
215 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  32.58 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  34.82 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  35 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.54 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  34.22 
 
 
228 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 
219 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.99 
 
 
225 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  32.54 
 
 
232 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
238 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  34.86 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  33.01 
 
 
236 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 
218 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 
226 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.86 
 
 
218 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.86 
 
 
218 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.39 
 
 
228 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  34.76 
 
 
236 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.32 
 
 
218 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  30.33 
 
 
232 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.4 
 
 
218 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  35.12 
 
 
215 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  34.4 
 
 
218 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 
228 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  34.4 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
219 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 
234 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 
216 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  34.76 
 
 
236 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 
220 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.4 
 
 
218 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  34.76 
 
 
231 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3822  phosphate uptake regulator, PhoU  28.99 
 
 
223 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  33.81 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  32.11 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  31.58 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  34.29 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  33.96 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  33.96 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  34.76 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  31.1 
 
 
244 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  32.38 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  32.38 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  32.38 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  32.38 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  31.9 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
241 aa  94.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  31.9 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  29.78 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1564  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.416794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 
256 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 
217 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  31.9 
 
 
244 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  34.92 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  33.81 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.31 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  34.72 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>