More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3470 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
408 aa  802    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  85.78 
 
 
410 aa  699    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  76.87 
 
 
410 aa  623  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.24 
 
 
297 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.36 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.61 
 
 
277 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.22 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  35.07 
 
 
368 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  35.74 
 
 
443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.81 
 
 
357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  34.77 
 
 
534 aa  163  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.04 
 
 
471 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.03 
 
 
347 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.8 
 
 
333 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.8 
 
 
330 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.96 
 
 
553 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.49 
 
 
550 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  31.96 
 
 
400 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  31.62 
 
 
379 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.55 
 
 
309 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.13 
 
 
520 aa  156  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  32.53 
 
 
375 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  35.84 
 
 
349 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  31.96 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  37.18 
 
 
365 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.21 
 
 
472 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  32.84 
 
 
359 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.46 
 
 
288 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.75 
 
 
365 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  33.68 
 
 
337 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.55 
 
 
329 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.11 
 
 
274 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.21 
 
 
309 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  34.23 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.97 
 
 
279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.07 
 
 
416 aa  133  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.6 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.13 
 
 
326 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.92 
 
 
303 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.58 
 
 
304 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.5 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.17 
 
 
248 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.5 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.39 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  28.05 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.64 
 
 
250 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.58 
 
 
298 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.42 
 
 
248 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  28 
 
 
251 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  28.31 
 
 
251 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  28.31 
 
 
251 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  28.31 
 
 
251 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  27.48 
 
 
251 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  27.85 
 
 
251 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  27.4 
 
 
251 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  28.31 
 
 
251 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.22 
 
 
246 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.7 
 
 
250 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  28.68 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  31.15 
 
 
281 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.94 
 
 
395 aa  94.4  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  26.51 
 
 
236 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  26.51 
 
 
236 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.04 
 
 
258 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  27.44 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  26.39 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.78 
 
 
253 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.51 
 
 
247 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.91 
 
 
236 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  26.05 
 
 
236 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  26.05 
 
 
236 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  26.05 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.96 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  25.58 
 
 
236 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.03 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0252  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.38 
 
 
231 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2921  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.4 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.03619  normal  0.0371299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.97 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.97 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.51 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.57 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.25 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.97 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.11 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.61 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  39.58 
 
 
107 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.79 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2338  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.34 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2287  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.34 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  37.89 
 
 
107 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  35.04 
 
 
572 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  32.38 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.46 
 
 
103 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.81 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  37.5 
 
 
105 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  37.17 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.9 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0081  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.86 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.53662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>