173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3349 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
284 aa  587  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  48.41 
 
 
284 aa  268  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.18 
 
 
275 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.37 
 
 
303 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.58 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35 
 
 
291 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  35.62 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.09 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.87 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.83 
 
 
301 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.2 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.55 
 
 
673 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  38.46 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.1 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.13 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.27 
 
 
296 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.21 
 
 
530 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.27 
 
 
296 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.65 
 
 
307 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  37.84 
 
 
296 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.99 
 
 
277 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.78 
 
 
271 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.8 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  33.8 
 
 
271 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  36.16 
 
 
262 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  36.16 
 
 
262 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  35.71 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.43 
 
 
262 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  31.15 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  31.32 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  31.15 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  31.15 
 
 
253 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  35.63 
 
 
251 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.13 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  31.98 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.8 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.36 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.52 
 
 
304 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  34.55 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  31.89 
 
 
259 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  30.94 
 
 
253 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.48 
 
 
263 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.48 
 
 
263 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  31.28 
 
 
263 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.39 
 
 
704 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.2 
 
 
254 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.88 
 
 
264 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.6 
 
 
251 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32 
 
 
273 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.21 
 
 
310 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30 
 
 
305 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  27.88 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  27.88 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.45 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.49 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.87 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.49 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  30.87 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  30.8 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.57 
 
 
274 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  30.13 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  29.69 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.96 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.69 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.69 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  33.68 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.44 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  26.84 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.45 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  31.44 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.64 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  27.17 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  28.14 
 
 
163 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  27.51 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  24.82 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  27.53 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  28.81 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  26.21 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  28.19 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  29.83 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  29.83 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  29.83 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  29.83 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  29.83 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  29.53 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  25.51 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.52 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.63 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0837  N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.42 
 
 
354 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1587  DNA adenine methylase Dam  24.91 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.893709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>