More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3185 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  92.7 
 
 		 466 aa  872    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 466 aa  950    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  45.49 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  46.25 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  43.75 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  43.47 
 
 		 590 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  43.19 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  44.28 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  43.53 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  43.78 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  44.37 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  42.95 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  42.67 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  44.35 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  42.98 
 
 		 479 aa  359  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  40.51 
 
 		 451 aa  353  5e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  43.45 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  42.33 
 
 		 494 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  40.56 
 
 		 462 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  39.39 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  39.5 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  43.81 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  38.71 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  38.97 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  37.2 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  36.83 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  37.3 
 
 		 551 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  34.9 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  32.85 
 
 		 654 aa  196  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  33.25 
 
 		 652 aa  193  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  34.52 
 
 		 647 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  33.42 
 
 		 650 aa  186  8e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 558 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  29.27 
 
 		 558 aa  146  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  29.38 
 
 		 555 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  29.72 
 
 		 551 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  30.23 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  30.15 
 
 		 561 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  28.42 
 
 		 548 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  29.56 
 
 		 545 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  29.72 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 		 545 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  29.36 
 
 		 602 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  28.65 
 
 		 548 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.57 
 
 		 558 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  28.35 
 
 		 551 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  29.12 
 
 		 542 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.2 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  28.79 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  29.46 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 		 590 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  29.2 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  29.2 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  29.2 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  29.17 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  29.53 
 
 		 666 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.87 
 
 		 548 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  28.76 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.31 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  29.01 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  28.12 
 
 		 479 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 550 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.41 
 
 		 485 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 485 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  28.61 
 
 		 581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  27.76 
 
 		 548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.72 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  29.37 
 
 		 951 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.12 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 559 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  27.91 
 
 		 557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  30.77 
 
 		 630 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 658 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.51 
 
 		 385 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  28.24 
 
 		 781 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 		 649 aa  123  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  28.5 
 
 		 564 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  27.64 
 
 		 838 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.13 
 
 		 555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  25.58 
 
 		 818 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 698 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 633 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.84 
 
 		 720 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  23.46 
 
 		 732 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  26.45 
 
 		 866 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  37.58 
 
 		 630 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  27.29 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  26.05 
 
 		 706 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  23.14 
 
 		 696 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  32.61 
 
 		 886 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  26.82 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  36.26 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  24.59 
 
 		 744 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>