More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3058 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  66.9 
 
 		 280 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  67.57 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  66.55 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  45.38 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 230 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  33.75 
 
 		 215 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  30.89 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  29.88 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  34.09 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  32.37 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 226 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  31.71 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  33.6 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  31.67 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  29.44 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  31.97 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  30.38 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  28.83 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 208 aa  99  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  34 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  44.88 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  32.5 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  28.79 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 216 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  29.5 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  31.09 
 
 		 215 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  29.72 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  38.69 
 
 		 202 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 210 aa  93.2  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 210 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 213 aa  92.4  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 212 aa  92  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  31.51 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  30.89 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  37.23 
 
 		 212 aa  89  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  41.51 
 
 		 212 aa  89  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  30.93 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.89 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  30.13 
 
 		 216 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  34.5 
 
 		 226 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  42.99 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  39.1 
 
 		 211 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  44.66 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 192 aa  85.5  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  41.35 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  32.35 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  35.04 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  38.35 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  34.74 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  34.64 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  34.29 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  33.91 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  39.5 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  38.13 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  36.91 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  39.81 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  30.85 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  36.23 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  36.23 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>