65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2804 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  100 
 
 
463 aa  934    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  79.91 
 
 
460 aa  764    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  48.16 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  43.89 
 
 
469 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  40.86 
 
 
464 aa  330  3e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  40.17 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  42.39 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  34.12 
 
 
462 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  33.98 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  38.7 
 
 
458 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  36.56 
 
 
474 aa  266  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  34.38 
 
 
470 aa  259  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  35.13 
 
 
464 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  34.62 
 
 
469 aa  256  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  38.62 
 
 
431 aa  254  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  33.4 
 
 
461 aa  249  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  36.27 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  36.03 
 
 
464 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  32.57 
 
 
473 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  31.79 
 
 
496 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  32.48 
 
 
454 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  33.42 
 
 
456 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  30.43 
 
 
457 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  34.59 
 
 
443 aa  208  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  31.4 
 
 
450 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  32.95 
 
 
420 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  32.57 
 
 
457 aa  188  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  28.94 
 
 
478 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  37.03 
 
 
439 aa  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  27.62 
 
 
462 aa  169  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  36.27 
 
 
439 aa  158  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  25.91 
 
 
456 aa  146  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  30.82 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  25.84 
 
 
456 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  31.16 
 
 
472 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  24.95 
 
 
509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  28.36 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  23.71 
 
 
456 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  28.9 
 
 
454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  28.43 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  29.16 
 
 
475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  27.67 
 
 
480 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  27.45 
 
 
470 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  29.47 
 
 
498 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  26.84 
 
 
407 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  28.83 
 
 
472 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.64 
 
 
474 aa  97.1  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1968  hypothetical protein  48.28 
 
 
98 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.249157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  25.61 
 
 
304 aa  87  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  23.87 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  22.78 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  26.46 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  22.54 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.41 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.67 
 
 
486 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  23.56 
 
 
283 aa  50.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  23.16 
 
 
279 aa  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  27.08 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.67 
 
 
506 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  22.46 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  34.31 
 
 
105 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  23.65 
 
 
342 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  22.4 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  26.25 
 
 
390 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  26.15 
 
 
390 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>