More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2692 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  83.61 
 
 		 375 aa  648    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  81.62 
 
 		 370 aa  638    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  100 
 
 		 370 aa  762    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  85.68 
 
 		 370 aa  672    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  79.46 
 
 		 373 aa  626  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  41.06 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  36.52 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  34.54 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  36.34 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  35.49 
 
 		 356 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  34.54 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  35.49 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  35.21 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  35.96 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  35.65 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  34.56 
 
 		 355 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  33.05 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.43 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.43 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  35.41 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.87 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.38 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.2 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.09 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  30.81 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  30.81 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.77 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.21 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  30.14 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  30.41 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  32.14 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  29.92 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.46 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  30.68 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.23 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.21 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.21 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  29.1 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.57 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.17 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  32.58 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  32.3 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.26 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  32.58 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  31.5 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  29.82 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  31.47 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  28.49 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  28.18 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  27.91 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  29.2 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  29.53 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  30.23 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.09 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  29.11 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  31.13 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.84 
 
 		 380 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  29.12 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  29.12 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  29.07 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  28.15 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  30.35 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  29.89 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  27.91 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.32 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  30.57 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  29.16 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.95 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  33.97 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  28.32 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.19 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.71 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  31.4 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  31.01 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  29.08 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  29.67 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  29.67 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  30.14 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  26.85 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  28.65 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  29.39 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  28.65 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  30.43 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  28.81 
 
 		 391 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  29.74 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  30.48 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  30.17 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  28.82 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  28.73 
 
 		 360 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  27.4 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  29.58 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  28.33 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>