More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2646 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  100 
 
 
391 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  41.37 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  41.81 
 
 
401 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  37.9 
 
 
400 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  39.12 
 
 
421 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  38.29 
 
 
407 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  38.37 
 
 
413 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.42 
 
 
441 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  35.24 
 
 
431 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.05 
 
 
440 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  36.89 
 
 
426 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  36.3 
 
 
445 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  34.29 
 
 
405 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  36.81 
 
 
455 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.43 
 
 
430 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  35.26 
 
 
430 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  36.47 
 
 
402 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  36.1 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  35.49 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  32.92 
 
 
426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.09 
 
 
407 aa  182  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  34.56 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  36.52 
 
 
412 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  36.27 
 
 
411 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  35.35 
 
 
408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  35.35 
 
 
408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  35.35 
 
 
408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  34.46 
 
 
444 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  33.89 
 
 
431 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  35.21 
 
 
426 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.12 
 
 
459 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  35.12 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  35.98 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  32.59 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  38.29 
 
 
408 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  34.07 
 
 
423 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  35.01 
 
 
433 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  31.98 
 
 
437 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  32.58 
 
 
433 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  32.14 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.18 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  33.33 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  37.16 
 
 
433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.84 
 
 
432 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  32.02 
 
 
422 aa  162  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.71 
 
 
434 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  33.5 
 
 
409 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  35.75 
 
 
422 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  34.75 
 
 
403 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.07 
 
 
423 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  31.97 
 
 
436 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  34.46 
 
 
418 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  35.65 
 
 
414 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  34.26 
 
 
448 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  33.24 
 
 
407 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  35.84 
 
 
423 aa  156  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
445 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  32.71 
 
 
401 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.17 
 
 
419 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.39 
 
 
413 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  30.43 
 
 
403 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  34.18 
 
 
428 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  32.86 
 
 
419 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  32.16 
 
 
402 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  30.6 
 
 
404 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.44 
 
 
417 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.62 
 
 
416 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  33.17 
 
 
429 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.5 
 
 
461 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.48 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.66 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.2 
 
 
414 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  30.46 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  36.05 
 
 
421 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  29.47 
 
 
408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  30.96 
 
 
413 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  35.42 
 
 
417 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  35.42 
 
 
417 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  35.42 
 
 
417 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.25 
 
 
391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 
443 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  34.1 
 
 
429 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  30.56 
 
 
413 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  30.47 
 
 
420 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.13 
 
 
396 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.83 
 
 
412 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  33.16 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  29.16 
 
 
470 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  32.3 
 
 
411 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  34.8 
 
 
424 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  32 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  31.16 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  32 
 
 
413 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  29.32 
 
 
425 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  28.05 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.3 
 
 
411 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  31.32 
 
 
412 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  31.34 
 
 
447 aa  133  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.05 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  30.32 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>