More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2492 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  76.28 
 
 
499 aa  725    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  100 
 
 
485 aa  935    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  60.04 
 
 
518 aa  598  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  67.21 
 
 
486 aa  594  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  60.71 
 
 
498 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  62.07 
 
 
490 aa  549  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  54.65 
 
 
500 aa  537  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  57.26 
 
 
470 aa  482  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  44.2 
 
 
538 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  44.12 
 
 
481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  42.54 
 
 
554 aa  355  8.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  40.87 
 
 
485 aa  347  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  42.32 
 
 
525 aa  345  8.999999999999999e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  37.67 
 
 
454 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  37.8 
 
 
500 aa  283  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  39.18 
 
 
500 aa  281  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  36.86 
 
 
505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
468 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  32.47 
 
 
462 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  29.54 
 
 
455 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.96 
 
 
460 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  32.22 
 
 
477 aa  223  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.89 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  30.42 
 
 
496 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  32.44 
 
 
466 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.04 
 
 
445 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
451 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
462 aa  200  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
467 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  30.44 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
462 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  30.11 
 
 
475 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  30.29 
 
 
470 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  30.46 
 
 
453 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.26 
 
 
464 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  28.88 
 
 
492 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  33.03 
 
 
463 aa  183  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.73 
 
 
454 aa  182  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  29.69 
 
 
448 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.3 
 
 
486 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  30.57 
 
 
484 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
448 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.66 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  29.42 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.38 
 
 
455 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
455 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
453 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
452 aa  171  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  30.51 
 
 
458 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.86 
 
 
454 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  32.44 
 
 
469 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  29.2 
 
 
463 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
494 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  31.11 
 
 
458 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.72 
 
 
453 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.14 
 
 
454 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
471 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.21 
 
 
469 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
452 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
475 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  30.09 
 
 
460 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
452 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
456 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.43 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.43 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.43 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
475 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.09 
 
 
454 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.43 
 
 
469 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
453 aa  156  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.95 
 
 
469 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
453 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
469 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.34 
 
 
457 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
475 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
452 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
480 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
451 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
465 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
456 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.82 
 
 
503 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
468 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25.38 
 
 
469 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.73 
 
 
469 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  29.16 
 
 
452 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
455 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.77 
 
 
476 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
455 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  27.83 
 
 
456 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  29.59 
 
 
428 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.21 
 
 
463 aa  150  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
524 aa  150  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
464 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  28.51 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  28.79 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>