281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2490 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 207 aa  272  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  44.92 
 
 		 194 aa  151  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 269 aa  124  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6134  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0948812  normal  0.0489287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  28.37 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  25.77 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  22.87 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  22.87 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  25.53 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 285 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  20.94 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  29.91 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  25.27 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  22.75 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>