38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2488 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  100 
 
 		 471 aa  945    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  64.35 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  47.24 
 
 		 451 aa  345  8e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  38.89 
 
 		 473 aa  246  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  36 
 
 		 415 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  35.53 
 
 		 431 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  35.53 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  35.06 
 
 		 431 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  35.76 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  36.39 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  39.78 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  31.77 
 
 		 522 aa  170  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  30.02 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  32.21 
 
 		 521 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  32.29 
 
 		 521 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  32.21 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  32.21 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  32.21 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  31.98 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  31.98 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  33.17 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  32.92 
 
 		 527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  32.92 
 
 		 527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  32.84 
 
 		 527 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  31.76 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  33.08 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  33.08 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  30.48 
 
 		 584 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  30.35 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  31.97 
 
 		 531 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1009 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1025 aa  120  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1002 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7054  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.8 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0229  glycosyl hydrolase family 32 protein  24.57 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.92 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.29 
 
 		 338 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3850  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.73 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183549  normal  0.803751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>