43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2448 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  74.4 
 
 		 250 aa  374  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  74 
 
 		 250 aa  370  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  72.18 
 
 		 247 aa  350  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  68.55 
 
 		 247 aa  348  4e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  54.03 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  54.32 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  53.85 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  51.82 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  50 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  49.2 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  52.59 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  48.41 
 
 		 278 aa  219  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  48.21 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  47.98 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  44.58 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  47.58 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  47.58 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  44.05 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  42.8 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  45.97 
 
 		 281 aa  186  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  41.77 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  34.38 
 
 		 387 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  37.5 
 
 		 363 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  35.02 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  36.61 
 
 		 363 aa  133  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  37.7 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  35.37 
 
 		 372 aa  121  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  26.81 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  26.81 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  24.79 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  26.41 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  30 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  28.17 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  30.82 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  30.82 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  25.43 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>