105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2447 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  69.05 
 
 		 84 aa  126  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  65.48 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  64.2 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  62.96 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  46.91 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  46.25 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  46.15 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.51 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  44.3 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  48.19 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  35.44 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  43.42 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  34.57 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  35.8 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  42.68 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  42.68 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  37.04 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  41.38 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  36.9 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  32.93 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  34.15 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  41.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  42.68 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  35.63 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  43.55 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  32.18 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  35 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  38.75 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  30.34 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  42.31 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  29.07 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  35 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  29.07 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  31.33 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  35.71 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  38.75 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  35 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  31.71 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  31.71 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  37.8 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  37.35 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  40.24 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 102 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  36.78 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  36.78 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  37.8 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  36.25 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  27.71 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  36.25 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  36.71 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  30.49 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  33.73 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  30.49 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>