More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2445 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  78.72 
 
 		 140 aa  228  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  77.3 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  76.6 
 
 		 140 aa  216  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  73.57 
 
 		 141 aa  214  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  55.38 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  54.26 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  52.27 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  52.94 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  51.52 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 		 139 aa  139  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  51.08 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  52.21 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  49.62 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  50.39 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  46.97 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  51.85 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  45.93 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  52.34 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  50.75 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  46.97 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  47.73 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  47.69 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  48.44 
 
 		 187 aa  128  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  51.11 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  46.21 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  40.44 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  39.01 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  41.09 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  45.52 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  40.44 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  38.46 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  47.62 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  42.17 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  41.86 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  45.78 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  42.17 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  46.48 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  52.83 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  46.15 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  37.78 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  43.18 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  42.25 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  42.31 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  44.19 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  40.23 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  52.83 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  43.48 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  38.82 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  40.48 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  39.29 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  47.54 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216881  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  44.29 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  47.54 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000040228  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  40.48 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  42.67 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  44.93 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  47.27 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  45.31 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  42.67 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  45.31 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  43.06 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  50.94 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  43.04 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  40.51 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  40.48 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  40.23 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  44.26 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  47.27 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  39.24 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  42.65 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>