33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2444 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  67.63 
 
 		 165 aa  196  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  68.35 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  63.33 
 
 		 153 aa  193  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  59.33 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  36.91 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  35.1 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  37.84 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  38.93 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  38.26 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  36.49 
 
 		 168 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  35.14 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  35.14 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  35.14 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  37.84 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  34.48 
 
 		 185 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  33.33 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  35.57 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  34.72 
 
 		 198 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  35.42 
 
 		 185 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  31.51 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  35.76 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  30.87 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  31.33 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  29.61 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.5 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  39.53 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  27.03 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  29.77 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  26.14 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  28.95 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>