64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2383 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  100 
 
 
383 aa  761    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  54.31 
 
 
378 aa  355  1e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  49.87 
 
 
381 aa  343  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  49.46 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  50 
 
 
392 aa  329  6e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  38.1 
 
 
369 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  37.43 
 
 
369 aa  225  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  34.44 
 
 
550 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  34.26 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  30.65 
 
 
364 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  39.13 
 
 
493 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  32.21 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  33.21 
 
 
494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  33.21 
 
 
494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  40 
 
 
503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  39.56 
 
 
491 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  31.29 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  31.6 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  34.58 
 
 
499 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  30.08 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  40.93 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  40.11 
 
 
491 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  40.68 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  30.07 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  30.5 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  36.41 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  28.92 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  34.82 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  36.32 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  28.44 
 
 
342 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  32.24 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  32.87 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  31.93 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  31.48 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  33.18 
 
 
423 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  32.75 
 
 
350 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  34.31 
 
 
493 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  28.49 
 
 
341 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  30.43 
 
 
505 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  30.74 
 
 
501 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  30.74 
 
 
501 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  28.48 
 
 
499 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  25.75 
 
 
684 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  31.84 
 
 
500 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  33.91 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  26.35 
 
 
834 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  28.78 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  27.22 
 
 
241 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  27.22 
 
 
241 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  26.82 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  26.95 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  26.35 
 
 
241 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  25.15 
 
 
241 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  27.71 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  25.15 
 
 
241 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  25.15 
 
 
241 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  25.15 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  27.4 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  34.78 
 
 
484 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  26.19 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  23.9 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  24.14 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  27.98 
 
 
373 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  28.07 
 
 
378 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>