241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2302 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  100 
 
 
293 aa  569  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  73.88 
 
 
296 aa  381  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  70.45 
 
 
291 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  72.01 
 
 
293 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  72.57 
 
 
291 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  42.43 
 
 
302 aa  208  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  42.24 
 
 
301 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  41.25 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  40.92 
 
 
301 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  38.41 
 
 
312 aa  182  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  36.6 
 
 
311 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  37.7 
 
 
309 aa  171  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  35.12 
 
 
309 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  34.63 
 
 
311 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  36.54 
 
 
307 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  34.31 
 
 
305 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  34.31 
 
 
305 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  32.53 
 
 
300 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  37.5 
 
 
315 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  34.18 
 
 
309 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  35.42 
 
 
305 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  34.59 
 
 
300 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  38.05 
 
 
320 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  36.82 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  34.93 
 
 
309 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  34.93 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  34.93 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  34.93 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  34.93 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  33.21 
 
 
309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  34.19 
 
 
310 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  34.46 
 
 
315 aa  139  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  34.46 
 
 
315 aa  138  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  33.45 
 
 
315 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  32.78 
 
 
315 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  34.21 
 
 
304 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  35.12 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  33.45 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  34.24 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  32.78 
 
 
315 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  35.33 
 
 
303 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  33.46 
 
 
309 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  33.46 
 
 
309 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  33.46 
 
 
309 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  33 
 
 
302 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  32.18 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  36.55 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  36.55 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  36.45 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  32.36 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  35.02 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  37.37 
 
 
325 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  36.81 
 
 
296 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  37.13 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  33.09 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  37.58 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  30.19 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  32.65 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  31.18 
 
 
314 aa  128  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  32.3 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  31.75 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  35.17 
 
 
303 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  33.99 
 
 
314 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  35.03 
 
 
320 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  31.75 
 
 
309 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  30.72 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  32.01 
 
 
323 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  35.92 
 
 
302 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  31.75 
 
 
309 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  32.73 
 
 
323 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  35.61 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  31 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  32.69 
 
 
306 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  31.77 
 
 
318 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  35.03 
 
 
320 aa  119  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  36.24 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  31.4 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  31.92 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  28.32 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  32.37 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  33.57 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  31.39 
 
 
303 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  38.13 
 
 
304 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  32.29 
 
 
315 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  33.33 
 
 
308 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  36.22 
 
 
323 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  28.82 
 
 
304 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  33.7 
 
 
293 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  36.98 
 
 
317 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  34.6 
 
 
297 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  31.29 
 
 
318 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>