More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2256 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 
453 aa  898    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  64.13 
 
 
454 aa  551  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  61.43 
 
 
454 aa  535  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  57.6 
 
 
454 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  38.7 
 
 
452 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  38.29 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  37.93 
 
 
458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  37.44 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  37.25 
 
 
460 aa  295  8e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.42 
 
 
456 aa  294  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.14 
 
 
453 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  37.14 
 
 
455 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  37.31 
 
 
458 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  38.74 
 
 
480 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.11 
 
 
433 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.22 
 
 
447 aa  237  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  32.18 
 
 
449 aa  236  7e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  34.36 
 
 
434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  31.58 
 
 
455 aa  232  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.04 
 
 
452 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  38.22 
 
 
434 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.83 
 
 
454 aa  230  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  31.18 
 
 
437 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.45 
 
 
437 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  36.05 
 
 
445 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  31.22 
 
 
446 aa  223  8e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  30.34 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  34.15 
 
 
416 aa  219  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  38.34 
 
 
446 aa  216  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  31.18 
 
 
452 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.23 
 
 
445 aa  210  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  37.28 
 
 
460 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  33.03 
 
 
430 aa  206  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  33.63 
 
 
450 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  31.37 
 
 
465 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  32.88 
 
 
430 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.75 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.7 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2460  Phosphoglucosamine mutase  35.55 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.21 
 
 
430 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  30.04 
 
 
449 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1418  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.79 
 
 
482 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  32.68 
 
 
447 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 
449 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  34 
 
 
450 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  33.63 
 
 
448 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  31.32 
 
 
462 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
445 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  33.04 
 
 
465 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  29.55 
 
 
449 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  34.37 
 
 
446 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  31.76 
 
 
450 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  31.84 
 
 
450 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  32.54 
 
 
447 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
439 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  34.22 
 
 
466 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2039  phosphoglucosamine mutase  31.59 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.16 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  32.39 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
448 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1597  phosphoglucosamine mutase  29.23 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  31.69 
 
 
462 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.86 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  30.48 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  33.78 
 
 
447 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  34.54 
 
 
450 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  34.44 
 
 
446 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  32.55 
 
 
447 aa  183  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  29.88 
 
 
478 aa  183  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  33.18 
 
 
450 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  33.86 
 
 
446 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  34.38 
 
 
446 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  33.86 
 
 
446 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0383  phosphoglucosamine mutase  29.23 
 
 
451 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  32.32 
 
 
444 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  31.56 
 
 
468 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.35 
 
 
418 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  32.89 
 
 
450 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  31.05 
 
 
451 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  32.66 
 
 
419 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.61 
 
 
472 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.8 
 
 
416 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  32.18 
 
 
469 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  30.02 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21950  phosphoglucosamine mutase  31.88 
 
 
450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292895  hitchhiker  0.00779909 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  30 
 
 
471 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  31 
 
 
448 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0409  phosphoglucosamine mutase  29.23 
 
 
445 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  30.19 
 
 
467 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.66 
 
 
470 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  31.61 
 
 
451 aa  179  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  33.26 
 
 
447 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  31.61 
 
 
451 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  32.68 
 
 
469 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  30.26 
 
 
461 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  30 
 
 
471 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  30.36 
 
 
462 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  29.02 
 
 
446 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  29.72 
 
 
464 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  32.81 
 
 
445 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>