More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2170 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  52.84 
 
 
233 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
246 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.93 
 
 
242 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  50.42 
 
 
715 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 
233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51.14 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50.44 
 
 
232 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.64 
 
 
234 aa  217  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
222 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.96 
 
 
236 aa  217  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
229 aa  217  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.23 
 
 
237 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50.21 
 
 
653 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  50 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  50.23 
 
 
227 aa  215  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.51 
 
 
226 aa  215  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1518  ABC transporter related  58.33 
 
 
222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52.97 
 
 
238 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.77 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  49.08 
 
 
408 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  50 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  50.93 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  50.91 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.24 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  51.39 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.12 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.33 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  49.77 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.53 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  49.54 
 
 
241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.55 
 
 
252 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.58 
 
 
237 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.71 
 
 
242 aa  210  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 
240 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.93 
 
 
258 aa  209  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  49.53 
 
 
229 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  49.55 
 
 
654 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  50 
 
 
668 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  50 
 
 
668 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  46.12 
 
 
667 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  47.22 
 
 
236 aa  209  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  53.24 
 
 
660 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  53.46 
 
 
265 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  46.12 
 
 
667 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  52.11 
 
 
224 aa  209  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  51.57 
 
 
280 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.2 
 
 
656 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  49.75 
 
 
228 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  45.66 
 
 
652 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  45.66 
 
 
682 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  47.49 
 
 
241 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  47.03 
 
 
241 aa  208  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  46.51 
 
 
656 aa  208  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  48.58 
 
 
228 aa  208  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.4 
 
 
252 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  45.66 
 
 
682 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  49.53 
 
 
234 aa  207  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 
232 aa  207  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.23 
 
 
266 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  49.77 
 
 
277 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  44.29 
 
 
652 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.29 
 
 
646 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 
227 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 
255 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  50 
 
 
241 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  49.19 
 
 
271 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.64 
 
 
648 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.3 
 
 
248 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
224 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.64 
 
 
648 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  49.77 
 
 
234 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.3 
 
 
248 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 
252 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.64 
 
 
648 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
236 aa  205  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  47.69 
 
 
223 aa  205  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
220 aa  205  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  47.22 
 
 
226 aa  204  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.74 
 
 
228 aa  205  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.69 
 
 
230 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.64 
 
 
648 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.71 
 
 
244 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  43.84 
 
 
249 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  48.18 
 
 
655 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  50.23 
 
 
226 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  47.03 
 
 
241 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.64 
 
 
648 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  50.44 
 
 
258 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  48.47 
 
 
241 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.53 
 
 
234 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.19 
 
 
235 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  46.58 
 
 
648 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>