72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2110 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 249 aa  490  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.87 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  30.85 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.8 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  31.55 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  25.63 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.24 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  25.81 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  26.07 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  32.61 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  27.41 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.92 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  29.83 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.5 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.07 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  24.46 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  26.95 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.57 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  26.42 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.41 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.29 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  25.94 
 
 		 301 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  31.9 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.94 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  28.89 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  27.22 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  27.8 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  29.27 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.52 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.59 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  28.04 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  29.24 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.59 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  28.32 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.95 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  25.64 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.67 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  25.73 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  31.02 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  27.04 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  30.23 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  30.23 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  32.5 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  30.23 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.42 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  23.58 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  30.77 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.18 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2490  xylose isomerase domain-containing protein  34.88 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00709656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  25.65 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.07 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  30.59 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2372  hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0241326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  27.85 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  27.4 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  26.23 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  29.76 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  24.1 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  28.03 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  25.73 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0983  hypothetical protein  21.02 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00469912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  29.46 
 
 		 313 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  29.82 
 
 		 306 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  24.26 
 
 		 273 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  29.82 
 
 		 306 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>