239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2109 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  734    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.28 
 
 
380 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  50.98 
 
 
395 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  49.72 
 
 
365 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  48.18 
 
 
383 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  48.6 
 
 
362 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.04 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  48.2 
 
 
360 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
366 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  47.91 
 
 
364 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  47.91 
 
 
364 aa  322  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.25 
 
 
364 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
373 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  45.98 
 
 
367 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  45.98 
 
 
367 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 
367 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  45.98 
 
 
367 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  45.98 
 
 
367 aa  316  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  45.98 
 
 
367 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  45.98 
 
 
367 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  45.98 
 
 
367 aa  316  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  45.71 
 
 
367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  46.93 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  46.28 
 
 
367 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  46.28 
 
 
367 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  46.01 
 
 
367 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  46.01 
 
 
367 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  45.73 
 
 
367 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  45.03 
 
 
367 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  46.48 
 
 
369 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  46.48 
 
 
369 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  46.48 
 
 
369 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  46.2 
 
 
369 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  43.73 
 
 
367 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
365 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  42.74 
 
 
376 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.68 
 
 
374 aa  289  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  43.41 
 
 
364 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
363 aa  271  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  43.02 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  43.14 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  42.86 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  43.02 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
368 aa  253  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  42.46 
 
 
371 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
367 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
364 aa  248  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  41.76 
 
 
374 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
364 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  36.06 
 
 
379 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  37.7 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  38.42 
 
 
371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
381 aa  219  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  38.82 
 
 
365 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
362 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  33.88 
 
 
367 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
373 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  31.48 
 
 
366 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  33.89 
 
 
417 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.04 
 
 
385 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
378 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  31.52 
 
 
359 aa  156  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  32.59 
 
 
366 aa  155  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
396 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
360 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  27.14 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.04 
 
 
367 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
358 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  28.24 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
367 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  30.75 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  30.43 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  28.41 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  32.58 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  32.42 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  32.58 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  32.42 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  32.42 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  32.58 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  32.58 
 
 
362 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  32.58 
 
 
362 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  32.58 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  32.58 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  32.58 
 
 
362 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  27.38 
 
 
363 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.48 
 
 
339 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  31.49 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  31.17 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  31.17 
 
 
362 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  31.17 
 
 
362 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  27.63 
 
 
359 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>