11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2033 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2033  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  261  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.127382  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2057  hypothetical protein  38.52 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  32.31 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  37.31 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0600  hypothetical protein  36.07 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0051  hypothetical protein  27.68 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  33.63 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0246  hypothetical protein  29.17 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45766  predicted protein  30.53 
 
 
201 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2509  hypothetical protein  30.53 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.458827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0404  hypothetical protein  34.75 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>