217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2024 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  72.91 
 
 
486 aa  751    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 
502 aa  1019    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  73.2 
 
 
488 aa  735    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  72.91 
 
 
488 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  49.3 
 
 
500 aa  478  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  48.39 
 
 
482 aa  476  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  50 
 
 
486 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  48.28 
 
 
482 aa  464  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  48.28 
 
 
484 aa  455  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  47.77 
 
 
480 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  46.18 
 
 
484 aa  449  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  47.98 
 
 
480 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  46.08 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  45.75 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  45.67 
 
 
498 aa  442  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  45.75 
 
 
474 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  46.46 
 
 
480 aa  444  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  47.17 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  46.46 
 
 
484 aa  433  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  46.46 
 
 
484 aa  430  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  48.89 
 
 
473 aa  428  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  46.31 
 
 
493 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  48.89 
 
 
477 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  46.96 
 
 
478 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  44.74 
 
 
477 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  44.97 
 
 
486 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  45.13 
 
 
486 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  43.98 
 
 
477 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  45.31 
 
 
485 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  46.31 
 
 
476 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  44.31 
 
 
485 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  47.64 
 
 
477 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  43.91 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  45.26 
 
 
486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  45.13 
 
 
486 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  44.56 
 
 
460 aa  402  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  44.44 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  44.44 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  43.29 
 
 
477 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  45.25 
 
 
475 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  44.49 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  45.89 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  42.37 
 
 
482 aa  397  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  44.38 
 
 
476 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  42.94 
 
 
486 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  42.94 
 
 
486 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  44.18 
 
 
476 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  41.46 
 
 
472 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  44.27 
 
 
476 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  45.16 
 
 
476 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  47.12 
 
 
477 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  43.23 
 
 
480 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  44.79 
 
 
477 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  41.24 
 
 
443 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  43.2 
 
 
481 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  43.31 
 
 
476 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  41.88 
 
 
485 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  44.49 
 
 
479 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  43.51 
 
 
475 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  47.02 
 
 
472 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  46.62 
 
 
963 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  44.2 
 
 
487 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  43.87 
 
 
488 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  43.79 
 
 
487 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  43.29 
 
 
473 aa  362  6e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  45.79 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  45.15 
 
 
484 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  41.12 
 
 
473 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  44.24 
 
 
465 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  40.76 
 
 
478 aa  340  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  39.63 
 
 
514 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  43.74 
 
 
432 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  45.89 
 
 
475 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  43.89 
 
 
988 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  38.24 
 
 
462 aa  313  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  37.04 
 
 
447 aa  293  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31 
 
 
451 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.82 
 
 
396 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  30.16 
 
 
405 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  29.27 
 
 
405 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  30.29 
 
 
408 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  30.24 
 
 
408 aa  162  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  29.93 
 
 
405 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  30.36 
 
 
408 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30.29 
 
 
408 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  30.07 
 
 
408 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  30.07 
 
 
408 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  30.07 
 
 
408 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  30.07 
 
 
408 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.62 
 
 
398 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.72 
 
 
404 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.84 
 
 
408 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  31.54 
 
 
406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.72 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.39 
 
 
409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.17 
 
 
401 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  31.38 
 
 
408 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30.7 
 
 
406 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  30.32 
 
 
409 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  30.58 
 
 
514 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>